A estrutura do ICEB é composta por Núcleos de Pesquisa formados por estudantes dos anos finais do Ensino Fundamental, do Ensino Médio e da Educação de Jovens e Adultos (EJA), sob a orientação de um professor. Esses núcleos desenvolvem projetos investigativos organizados em dois eixos principais:
- Territórios de Iniciação Científica (TICs): fomentam a pesquisa sobre temas diversos, como ciência, tecnologia, meio ambiente, direitos humanos, diversidade, juventudes e cultura, articulando o conhecimento escolar com a realidade local.
- Núcleos de Pesquisa e Estudos Africanos, Afro-Brasileiros e da Diáspora (NUPEAAS): promovem a valorização da história, cultura, ciência e tecnologia dos povos africanos e afro-brasileiros, em consonância com as Leis nº 10.639/2003 e nº 11.645/2008, fortalecendo o compromisso da escola com a Educação para as Relações Étnico-Raciais (ERER).
Essa estrutura garante que os projetos de pesquisa estejam articulados com o território, com o Currículo Referência de Minas Gerais (CRMG), especialmente com o desenvolvimento dos temas transversais, e com os marcos legais da educação básica, assegurando coerência formativa e aprofundamento investigativo no contexto escolar.
A organização do ICEB ocorre por meio de editais públicos publicados pela SEE/MG, que regulamentam a seleção dos projetos dos Núcleos de Pesquisa, com seus respectivos professores orientadores, bem como dos professores tutores e professores curadores.
Esse processo assegura a transparência, a equidade e a ampla participação das escolas e dos profissionais da rede estadual de ensino, possibilitando que estudantes e educadores integrem o Programa de forma estruturada e alinhada às diretrizes institucionais.
A operacionalização do Programa envolve diferentes atores institucionais que atuam de maneira colaborativa e complementar, fortalecendo o processo formativo dos estudantes e assegurando o desenvolvimento adequado dos projetos de pesquisa. Cada ator cumpre funções específicas, articuladas entre si, de forma a garantir coerência pedagógica, suporte técnico e acompanhamento contínuo dos Núcleos de Pesquisa.

Fonte: Elaborado pela SEE/MG.
Os Núcleos de Pesquisa contam com o acompanhamento de professores tutores e com o apoio dos professores curadores, ambos especialistas com formação em nível de pós-graduação e experiência comprovada em pesquisa científica. Os tutores orientam os núcleos quanto aos aspectos metodológicos e à elaboração dos projetos de pesquisa. Os curadores integram o Núcleo Gestor do ICEB, colaborando na formação dos docentes, na análise dos projetos e na orientação sobre ética e segurança em pesquisa.
As experiências desenvolvidas no âmbito do ICEB têm conquistado reconhecimento em feiras científicas, congressos e publicações acadêmicas, no Brasil e no exterior. O trabalho em rede entre os diferentes atores asseguram a qualidade e o bom andamento das pesquisas nas escolas da rede estadual mineira, fortalecendo o diálogo entre escola, ciência e comunidade.